可是，以上这三种说法均缺乏有实证价值和充足理由的证据。比如，关于匿于穹窿山之说，主要是因为穹窿山有福臻禅院，而朱棣的军师姚广孝曾在那里当过主持，传言是姚广孝在“靖难之役”后拒绝官爵厚禄，辞别朱棣，隐于穹窿山归隐禅寺中，而他秘密保护了逃亡的建文帝，乃是心有愧疚，藏文帝是报恩。此说的证据有：一是拈花寺后的小山冈只准许帝王、僧宗归宿营养，不能随意侵扰，且山口有“三皮村”，乃是“三避村”之意。二是《苏州府志》《木渎小志》里均有“建文逊国曾稅驾于此”“积翠庵、一名皇驾庵，明建文帝逊国时曾稅驾于此“等记载，且有记载称：“姚少师道场在焉，相去数武，有皇驾庵一片地，犹称隐僻......相传建文帝逊国曾稅于此也。”（张有誉《积翠庵纪略》）三是穹窿山下有一条小径称“万人泾浜”，其苏州方言为“犯人泾浜”，据说当时为避免皇坟消息泄漏，造墓匠人全是犯人，墓造好皆被杀死，埋于浜下。四是当地发现了两块“皇驾庵”的碑刻。但所有这些“证据”，皆是带着联想，并非确凿证据。至于辗转于南洋之说和隐栖于九嶷山之说亦证据不充分，令人难以信服。
此外，还有建文帝晚年归燕都之说，一是传言明英宗正统五年(1440年)，太监吴诚遇到一位年已六旬的老人，老人自称是建文帝，因为张三丰说他经历了四十年的痛苦经历，修德已满，可以返国了，因而建文回到了都城。二是王鳌《震泽纪闻》有记载，有一位御史遇到一位老僧，当道而立，任左右呵斥，他岿然不动，御史后来知是建文帝，随即被送回燕都，而英宗唤老太监吴亮来辨认，老僧随即认出了吴亮直呼其名，吴亮假装否认，而老僧笑着表示，当年他在便殿吃鹅，将鹅肉掉地上，吴亮手提茶壶，趴在地上用嘴叼起，难道会忘记吗？吴亮立即扑跪，泣不成声，知道老僧即是建文帝，后来，老僧在宫中安度晚年，死后葬于西山，号称“天下大师”，据说，后来有了在颐和园后的红山上找到“前明天下大师之墓”墓碑。不过，这两种说法也只是传说，或根据野史闲言而传播的，没有确凿证据。
关于建文帝出逃后的下落，有另外两种说法值得注意：一是说建文帝逃到了云南武定狮子山，在正续禅寺出家，这有一些古迹作根据，方志资料上也有一些依据；二是说建文帝逃到福建宁德，迷藏于支提寺修行，后葬于金贝村，这似乎有一些依据。
据说，建文帝在出逃后，去过一些地方，后来，逃到了云南武定的狮子山，并在山上的正续禅寺出家修行。武定狮
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