进一步分裂。
怎么撕呢？
一部分人在福建拥立唐王朱聿键继位，是为隆武政权。这是南明的第二个小朝廷。
另一部分人在浙江拥立鲁王朱以海监国。
南明的这两个小朝廷，互看对方不爽，为了争夺正统地位，形同水火。
1646年，趁着两个小政权互撕之际，清军一波攻击，攻下福建。两个小政权一并被灭。
鲁王朱以海被迫逃到海上。隆武帝则被郑芝龙绑了，送给清朝，沦为阶下囚。后与弘光帝和潞王朱常淓一起被清军斩杀。
在隆武政权、鲁王政权陆续被歼灭后，剩余的南明宗室和大臣继续逃亡至广东，拥立桂王朱由榔于广东肇庆继位，组建朝廷。这便是南明的第三个小朝廷——永历政权。
按理说，都惨成这幅模样了。总该可以消停了吧？应该要认真对付外患了吧？
然而，还是没有。
就在永历帝继位不久后，另一帮南明大臣在广州拥立隆武帝的弟弟朱聿鐭监国。这一派人不承认永历政权，同时永历政权的人也不承认朱聿鐭的监国身份。两边都视对方为伪政权。
广州距离肇庆很近，也就一百公里的路程。
两个小朝廷都说自己是正统，且都不承认对方的合法性。接下来发生的事情，也就不用说太多了——内战。
1646年底，见南明又在火并，还打得不亦乐乎。清军再一次出兵清场。
在清军的这波攻势下，绍武帝兵败自杀。永历政权则遭重创，被清军驱赶到了广西。
形势发展到这里，南明控制的武装，基本是十不存一。也就万余人了。可以说，再不与农民军联手，怕是连大西南的土著部落都能把所谓的南明朝廷给灭了。
于是，在认清了形势后，永历政权终于承认了大顺军、大西军是可以合作的盟友，并与之合作。获得了近20万人的生力军。
但是，当永历政权和大顺军合作，并取得了一些战果，如收复湖南、广东后。南明内讧的传统艺能又开始了。
而内讧的结果，就是收复不久的地盘，再次沦陷。并且大顺军还自成一系，独立在三峡地区抗清，号称夔东十三家，只在名义上接受永历帝册封。不再直接听命于永历朝廷的指挥了。
可以说，永历帝在做了四年皇帝后，被一帮作死的大臣作成了光杆司令。
1650年前后，见永历政权摇摇欲坠，盘踞在滇黔地区的大西军主动提出合作意
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